Pitagora je, u svoje vrijeme, bio poznat kao stručnjak o sudbinini ljudske duše, odnosno pitanju što se točno zbiva nakon smrti. Pitagorejci su vjerovali u besmrtnu dušu, koja se nakon smrti seli u neko drugo tijelo (metempsihoza iliti reinkarnacija). Ne nužno ljudsko.
Malo znamo o detaljima, ne možemo sa sigurnošću kazati jesu li smatrali da duša može ikad pobjeći iz tog kruga seljenja iz tijela u tijelo. I ne znamo je li iz jednog išla direktno u drugo ili su postojale nekakve stanke.
